El objetivo principal de la Maestría en Neurociencias es formar recursos humanos calificados, de alto nivel científico, actualizados y en condiciones de orientarse hacia la formación continua en el área del conocimiento que involucra la estructura, función y regulación del sistema nervioso en el sentido más amplio. Específicamente la Maestría se propone desarrollar un enfoque multidisciplinario que incluye aspectos moleculares, celulares, fisiológicos, comportamentales, cognitivos y patológicos. A su vez, pretende aportar conocimientos interdisciplinarios (desde la biología molecular hasta los estudios cognitivos y de  neuroimagen), para que los futuros investigadores  puedan abordar los problemas de manera traslacional e incorporarse a laboratorios de instituciones públicas y privadas. Otro objetivo de la carrera es desarrollar la capacidad de aplicar el método científico, el pensamiento creativo, lógico y crítico, actualizar conocimientos moleculares, celulares, neurofisiológicos y clínicos e integrarlos para abordar aspectos como la comprensión, la prevención o el tratamiento de enfermedades que afectan al sistema nervioso.